作物育种与种子科学系于2016年5月经公司院系调整后组建而成，包括作物遗传育种学和种子科学与工程学两个二级学科，其中作物遗传育种学为国家二级重点学科，是河南省2个国家二级重点学科之一。目前作物育种与种子科学系现有教职工24人，其中正教授8人，副教授9人，讲师7人，具有博士学位人员22人，博士生导师5人；河南省政府参事1名、河南省特聘教授1名、校特聘教授1名；获国务院特殊津贴专家1名；教育部新世纪优秀人才支持计划专家1名；河南省学术技术带头人1名。该系成员老中青分布合理，队伍以青年教师为主，在教学、科研等方面已经取得了累累硕果。
       作物育种与种子科学系主要承担本科生的试验设计与统计分析、生物统计学、种子检测、种子检验与检疫、种子经营与管理、种子生产、种子生理、种子政策与法规、作物育种学、基因工程等10门主干课程，同时肩负着硕士生、博士生的专业讨论、生物统计学等课程。
      自2016年5月份成立至今，育种与种子科学系获国家科技进步二等奖1项，河南省科技进步二等奖1项，审定小麦玉米新品种3个；共累计发表SCI论文50多篇，单篇影响因子3.0以上20多篇，单篇影响因子5.0以上6篇。